Bereits im Jahre 1999 fanden sich unter der Federführung des Mühlhäuser Wirtschaftsanwaltes Carsten Oehlmann und des seinerzeitigen Oberbürgermeisters Dieter Dörbaum herausragende Persönlichkeiten aus Wirtschaft, Banken und Politik zusammen und ließen sich den strategischen Ansatz des Erwerbs und der Sanierung einer der ältesten Kirchen in Mühlhausen erläutern. Die Kilianikirche, seit den 1960er Jahren profaniert und als Autowerkstatt und Ersatzteillager missbraucht, sollte die Heimat für die Theatergruppe 3 K e.V. werden und in der Kilianikirche eine neue Theaterspielstätte entstehen. Bewerkstelligt werden sollte dies durch die Gründung einer Stiftung des bürgerlichen Rechts. Nach Erlangung etlicher Zusagen für die finanzielle Ausstattung der Stiftung erfolgte die Gründung in den Abendstunden des 21. März 2001, die letztlich dann am 22.Oktober 2002 als rechtskräftige Stiftung des bürgerlichen Rechts mit Sitz in Mühlhausen unter dem Namen die „Die Kilianikirche – Stiftung für Kunst und Kultur“ anerkannt und in das Stiftungsregister des Freistaates Thüringen eingetragen wurde. Der Stiftungszweck beinhaltet die Förderung von Kunst und Kultur, kultureller Bildung und Erziehung im Unstrut-Hainich Kreis, insbesondere in der Stadt Mühlhausen. Dieser sollte u.a. erfüllt werden durch den Umbau der Kilianikirche in eine jugendkulturelle theaterähnliche Spielstätte und mindestens 10-jähriger unentgeltlicher Nutzung durch den ebenfalls gemeinnützige Theaterwerkstatt 3K e.V. Gleichzeitig erfolgte die Unterstützung verschiedene Projekte. Am 15. Oktober 2006 war der Spiel(T)Raum in Mühlhausen Wirklichkeit geworden, die Kilianikirche verwandelt und nicht verfallen, der wesentliche und namensgebende Stiftungszweck erfüllt. Seitdem ist die Stiftung ständig bestrebt, gemäß ihres Stiftungszweckes in der Region tätig zu sein. Es erfolgte der Ankauf eines weiteren Gebäudes in dem Gesamtareal, welches umfangreich saniert und seitdem mittels vergünstigter „Kulturmiete“ an die Jugendkunstschule und die LAG Spiel und Theater e.V. zur Verfügung gestellt wird. 2020 wurden „Die Hofgesellschaft“ im Mühlhäuser Ortsteil Eigenrieden und das Sorglos!-Theater direkt unter das Dach der Stiftung genommen und die Kulturfabrik „KUFA Mühlhausen“ sowie das „Theater der Nacht“ in Northeim in das Förderprogramm mit aufgenommen. Weiterhin werden immer wieder besondere Projekte unterstützt, wie z.B. 2022 die Mitmachausstellung „KREA:TUR:IA“ in der Kinder- und Jugendbibliothek in der Mühlhäuser Jakobikirche, die als herausragendes Beispiel der Umwidmung ehemals sakraler Gebäude in Thüringen gilt und bei der z.B. hinsichtlich einiger Gestaltungselemente Anleihen auch bei der Sanierung und dem Umbau der Kilianikirche genommen wurden. Diese Internetseite will über alle Initiativen und Aktivitäten, die mit Unterstützung der Stiftung entstehen und entstanden sind, informieren.